Mediante la R.J. Nº 010-2016-ANA se aprobó el «Protocolo Nacional para el Monitoreo de la Calidad de los Recursos Hídricos Superficiales», que estandariza los criterios y procedimientos técnicos para desarrollar el monitoreo de la calidad de los recursos hídricos tanto continentales (ríos, quebradas, lagos, lagunas, entre otras) como marino – costeros (bahías, playas, estuarios, manglares, entre otros). Este protocolo es de uso obligatorio a nivel nacional.